网站开发工程师职业定位,焦作市网站建设,win7本机做网站,构建一个网站需要什么ChimeraX使用教程-安装及基本操作
1、访问https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/download.html进行下载#xff0c;然后安装 安装完成后#xff0c;显示界面
2、基本操作
1、点击file#xff0c;导入 .PDB 文件。 #xff08;注#xff1a;在 alphafold在线预测蛋白》点…ChimeraX使用教程-安装及基本操作
1、访问https://www.cgl.ucsf.edu/chimerax/download.html进行下载然后安装 安装完成后显示界面
2、基本操作
1、点击file导入 .PDB 文件。 注在 alphafold在线预测蛋白》点击传送门link 结束后我们会得到一个 .zip 格式的压缩包解压缩打开后主要有 .JSON 、 .PDB 、.PNG 和文本文档类格式文件我们需要的是 .PDB 文件这里面存放着我们预测的蛋白结构结果。
2、点击file导入 .PDB 文件。
打开所有 .PNG 格式文件如下图每一张图都是对我们预测的蛋白模型的精准度反映。我们主要看图⑤可以清楚的看到蛋白不同区段的预测精准度峰值越高则越精准通过该图我们选择预测结果最精准的PDB文件进行可视化在此选rank1用于后续的分析。 3、蛋白互作界面分析
详细参考这位作者的详细文章》点击传送门link
参考
超实用用ChimeraX对AlphaFold 结果可视化上 https://zhuanlan.zhihu.com/p/617074237 超实用用ChimeraX对AlphaFold 结果可视化中: 蛋白结构美化篇 https://zhuanlan.zhihu.com/p/617939430
超实用用ChimeraX对AlphaFold 结果可视化下: 蛋白互作界面分析 https://zhuanlan.zhihu.com/p/633813760
