东莞建设银行网点查询,南宁seo咨询,近期热点舆情事件,微网站建设计划书最近在扫盲测序的一些知识 其中需要安装一些软件进行练习#xff0c;如质控的fastqc#xff0c;然后需要用conda来配置环境变量和安装软件。记录一下方便后续查阅学习
1.安装miniconda
由于我的电脑之前已经安装了brew#xff0c;所以我就直接用brew安装了
brew install …最近在扫盲测序的一些知识 其中需要安装一些软件进行练习如质控的fastqc然后需要用conda来配置环境变量和安装软件。记录一下方便后续查阅学习
1.安装miniconda
由于我的电脑之前已经安装了brew所以我就直接用brew安装了
brew install miniconda安装完成之后会有successful的提示
2. 查看miniconda是否安装成功
conda -V 检测是否安装成如果成功会出现版本信息 如果出现command not found之类的命令那么需要配置环境变量 解决方法 (1) vim ~/.zshrc 进入环境变量配置文件本人使用的sh是zsh (2) .zshrc中添加export PATH$PATH:/Users/yangshengyu/miniconda3/bin (3) source ~/.zshrc
3.使用miniconda
1创建python虚拟环境 用法
conda create -n env_name package_name例子
conda create -n my_env python3.62激活虚拟环境
conda activate my_env执行后报错conda activate parth usage: conda [-h] [–no-plugins] [-V] COMMAND … conda: error: argument COMMAND: invalid choice: ‘activate’ (choose from ‘clean’, ‘compare’, ‘config’, ‘create’, ‘info’, ‘init’, ‘install’, ‘list’, ‘notices’, ‘package’, ‘remove’, ‘uninstall’, ‘rename’, ‘run’, ‘search’, ‘update’, ‘upgrade’, ‘build’, ‘convert’, ‘debug’, ‘develop’, ‘doctor’, ‘index’, ‘inspect’, ‘metapackage’, ‘render’, ‘skeleton’, ‘verify’, ‘content-trust’, ‘repo’, ‘env’, ‘token’, ‘server’, ‘pack’) 谷歌了一下发现是因为我用的brew安装环境变量设置并不在.zshrc文件中因此需要进行 ①conda Initialisation
conda init zsh执行之后终端会显示系统修改列表并且在.zshrc中可以看到conda initialize
②重启终端
zsh -l③重新创建新环境然后激活
conda create -n my_env python3.6
conda activate my_env就可以成功使用了
3退出虚拟环境
conda deactivate4查看当前所有的虚拟环境
conda env list5删除虚拟环境
conda remove -n my_env --all6克隆虚拟环境
conda create -n new_env --clone my_env7在激活的环境中安装一个软件包
conda install package_name8从环境中删除一个软件包
conda remove package_name4.conda换源
conda config --show # 显示当前 conda 配置
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ # 添加清华源的免费仓库
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ # 添加清华源的主要仓库
conda config --set show_channel_urls yes # 显示添加的所有仓库地址
长腿猴子请来的救兵 写于2023年11月12日 一个阳光很好的下午
