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为了做项目还得学一手OpenGL#xff08;被windows安装GLFW逼疯了#xff09;
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打完ICPC EC final回来#xff0c;也许可以出一篇博客写下简单的题解。
对蛋白质相似空间子结…最近才开始看d2l这种东西早该在两年前看的拖到现在了
为了做项目还得学一手OpenGL被windows安装GLFW逼疯了
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打完ICPC EC final回来也许可以出一篇博客写下简单的题解。
对蛋白质相似空间子结构搜索的算法有了一些思路简单分为传统算法和目标检测算法
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想到要对蛋白质可视化然后去找可以用于三维绘图的库找到了OpenGL在wsl里面装了一个发现挺方便准备开始学[傅老師/OpenGL教學 第一章] OpenGL自製3D遊戲引擎 (已更畢)_哔哩哔哩_bilibili
然后发现蛋白质三维结构是需要跑alphafold的自己电脑根本跑不了还不如直接下载网上的已经预测好结构的数据集。
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1、UniProt
学习了UniProt网站的一些知识还有待进一步探索
struct里面可以查看各种蛋白质的三维结构蛋白质数据都是可以下载的
标了reviewed的数据可信度更高做实验优先选择这类数据
2、蛋白质三维结构比对算法
主要分为分子间距离比较和分子内距离比较。
分子间距离比较就类似迭代的做法通过刚体旋转使得蛋白质分子间的cRMS指标最小 分子内距离dRMS的判据一般用于蛋白质的局部空间结构比较可以绕过刚体旋转拟合的过程 结构比对算法已经有很多优秀的算法了比如CE、TM-align、DALI、VAST、K2、SHEBA等之类的似乎不用自己再写一个了。
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ipconfigping网址ssip link。
查看conda环境列表conda env list
删除conda环境conda env remove --name xxx必须在非激活状态下删除
创建conda环境conda create --name xxx python3.x
激活conda环境conda activate xxx
在某环境下安装某个包直接pip install
d2l网站之前找了好久都没找到今天一找就找到了安装 — 动手学深度学习 2.0.0 documentation
