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链接【Linux】解决Ubuntu服务器版本无法使用Clash Dashboard的问题 这个图展示了RNA-Seq实验数据生成的流程。下面是该流程的逐步解释
mRNA或总RNA提取首先从细胞或组织样本中提取mRNA或总RNA。mRNA是经过剪切的、成熟的RNA而总RNA包括mRNA和其他类型的RNA如核糖体RNA、转运RNA等。
去除污染的DNA由于RNA提取过程可能会带有DNA污染因此需要将这些DNA去除确保只对RNA进行测序。
RNA片段化为了使RNA适合于测序RNA被打断成更小的片段。
反转录成cDNARNA片段通过反转录酶被转化为互补DNAcDNA。cDNA是双链的与原始的RNA片段对应。
连接测序接头为了使cDNA片段能在测序机上被读取需要将特定的接头序列连接到cDNA的两端。
选择一定范围大小的片段通过大小选择步骤选择特定长度范围内的cDNA片段进行下一步测序。
测序cDNA末端最后选择的cDNA片段在测序机上被测序。这通常涉及到只测序cDNA片段的一端或两端称为单端测序和双端测序。
